Según la Hoja Cartográfica del Instituto Geográfico Nacional, el Río Mala Noche nace en las faldas de los Cerros del Tabaco, a unos 6 Km al NE de su desembocadura. Pasa cerca del poblado de Buenos Aires y llega al poblado del Torito, distrito Sámara, cantón Nicoya.
Tiene un afluente importante que es la Quebrada Mala Noche que nace en la falda del Cerro Arguedas y pasa por el poblado de Santo Domingo de Sámara de Nicoya.
Ambos se indican el el mapa abajo en color celeste.
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| Río Mala Noche y Quebrada Mala Noche señalados en color celeste |
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| Foto del lecho del Río Mala Noche a finales de la época seca en 2013 |
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| Foto del Río Mala Noche antes de llegar al estero. Al fondo poblado el Torito. Julio 2013 |
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| Foto del Río Mala Noche al final de la estación lluviosa 2013 |
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| Foto del lecho del Río Mala Noche en la estación seca 2014 |
